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IBM超级计算机筛选出77种抗病毒化合物,成抗疫新力量

更新时间  2021-09-19 05:39 阅读
本文摘要:在生死时速的抗疫比赛中,速率越是快就越好。在这次抗疫比赛的身后,高性能计算机变成了网络加速器。据Venturebeat报导,IBM添加了由美政府核心创立的COVID-19高性能计算同盟(HighPerformanceComputing,HPC),协助研究工作人员布署预测模型,剖析新冠肺炎疫情的发展趋势全过程,加快推动病毒医治过程。

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在生死时速的抗疫比赛中,速率越是快就越好。在这次抗疫比赛的身后,高性能计算机变成了网络加速器。据Venturebeat报导,IBM添加了由美政府核心创立的COVID-19高性能计算同盟(HighPerformanceComputing,HPC),协助研究工作人员布署预测模型,剖析新冠肺炎疫情的发展趋势全过程,加快推动病毒医治过程。应对病毒(包含COVID-19病毒)这类新生儿化学物质,研究工作人员会在试验室中塑造微生物菌种并观查其对导入的新生儿化学物质的反映,慢慢变小潜在性自变量的范畴。

但是,独立的自变量很有可能包括着数千万乃至数十亿个数据信息必须仿真模拟,仅依靠研究工作人员的观查,将是个极大的挑戰。现阶段,全世界正处在抵御肺炎疫情的特殊时期。数据信息显示信息,全世界新冠病案诊断已超33数万人(截止发表文章),且国外好几个我国正处肺炎疫情爆发期,诊断总数仍在持续飙升。在这次抗疫比赛中,时间获得胜利的关键要素。

对病毒的掌握多一点,对预苗的研究更近一步,新冠病毒的威协就少一分。IBM研究主管DarioGil在blog中表明,在临床流行病学、生物信息学和分子结构模型的试验中必须很多测算,假如手动式开展,试验必须多年才可以进行;假如在速率比较慢的传统式测算服务平台上实际操作也必须几个月的時间,而高性能计算机性能卓越的测算系统软件可以迅速处理这一测算难题。注:彩色图库extremetech据了解,IBM本次参加COVID-19研究的是Summit高性能计算机,是现阶段世界最强劲的高性能计算机。

它由4608台测算网络服务器构成,每一个网络服务器包括两个22核Power9CPU,6个NvidiaVoltaV100GPU。此外,Summit还有着超出10PB的储存器,其数学计算最大达到200PFlops。

在添加COVID-19高性能计算同盟以前,Summit在新冠肺炎疫情研究中就已获得了提升。英国棕榈岭国家级实验室(OakRidgeNationalLaboratory)研究工作人员表明其精英团队依靠Summit寻找到能够抵抗COVID-19的最有效的目前药品。经查看,其研究成效已发布至《ChemRxiv》杂志期刊,毕业论文名为“RepurposingTherapeuticsforCOVID-19:Supercomputer-BasedDockingtotheSARS-CoV-2ViralSpikeProteinandViralSpikeProtein-HumanACE2Interface”。

在该项研究中,研究工作人员从8000多种多样化学物质下手,依靠Summit的优化算法找寻能够与蛋白融合并阻拦病毒充分发挥的药品。基本数据显示,现阶段Summit已挑选出77种化学物质可以与Spike蛋白质融合,阻拦病毒表层的分子与人们体细胞上的血管紧张素2变换酶2(angiotensin-convertingenzyme2,ACE2)蛋白激酶相接。非常值得表明的是,虽然Summit测算可以在病毒研究层面充分发挥,但并不能够设计制作出一种治疗方法,其临床医学剖析全过程并不理想化,还需定点医疗机构对已挑选出的化学物质开展评定、检测才可以用以临床研究。

此外,Summit輔助研究的方式仅是协助减轻COVID-19的病症并提升 成活率,并非预苗研制开发。但是,在COVID-19高性能计算同盟中,除开IBM,还包含了Google、微软公司、美国能源部、伦斯勒理工学院等别的企业及其学术研究组织;而这种组织的数学计算一样在病毒研究中充分发挥着功效。美国亚马逊AWS单位起动一项方案,为研究组织和企业出示服务支持,推动COVID-19在确诊、医治、预苗等层面的研究。一样,微软公司也表明将根据拓展对Azure和高性能计算工作能力的浏览,与生物学家协作,为抵御COVID-19的研究工作人员出示所需专用工具。

伦斯勒理工学院将其人工智能技术多解决优化软件电子计算机(AiMOS)布署在伦斯勒测算创新中心,该学院表明正与研究组织触碰,适用与COVID-19相关的研究。愈来愈多的能量添加了抗疫竟速当中,应对新冠病毒这一人类的相互对手,多方面协力,抗疫成果终究会展现“1 12”。


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